生物物理・神経情報研究室


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2023年

  1. Madoka K. Utsumi, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    Transitions of motor neuron activities during Ciona development
    Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2023 Jan.
  2. Yubuki Nakamura, Marina Nasu, Yutaka Shindo, Kotaro Oka, Daniel Citterio, Yuki Hiruta
    Effect of the side chain composition of mixed-charge polymers on pH-selective cell–membrane interactions
    Polymer Journal 2023 Jan.
  3. Nozomu M.Totsuka, Satoshi Kuwana, Satoshi Sawai, Kotaro Oka, Yasunori Sasakura, and Kohji Hotta
    Distribution changes of non-self-test cells and self-tunic cells surrounding the outer body during Ciona metamorphosis
    Developmental Dynamics 2023 June.
  4. Keigo Fujita, Yutaka Shindo, Yuji Katsuta, Makiko Goto, Kohji Hotta and Kotaro Oka
    Intracellular Mg2+ protects mitochondria from oxidative stress in human keratinocytes
    Commun. Biol. 2023 Nov.
  5. Takumi T. Shito, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    Multimodal factor evaluation system for organismal transparency by hyperspectral imaging
    PLoS ONE. 2023 Oct.
  6. Boyan Lin, Wenjie Shi, Qiogxuan Lu, Takumi T. Shito, Haiyan Yu, Bo dong
    Establishment of a developmental atlas and transgenetic tools in the ascidian Styela clava
    Marine Life Science & Technology. 2023 Nov.
  7. Hirokazu Komatsu, Nadiia Velychkivska, Anastasiia B Shatan, Yutaka Shindo, Kotaro Oka, Katsuhiko Ariga, Jonathan P Hill, Jan Labuta
    Kinetic study of NADPH activation using ubiquinone-rhodol fluorescent probe and an IrIII-complex promoter at the cell interior
    RSC Advances 2023 Nov.
  8. Rei Kumada, Akihiro Sakama, Yutaka Shindo, Yuzuka Kuronuma, Naoko Iwasawa, Daniel Citterio, Kotaro Oka, Yuki Hiruta
    Development of Phosphinate Ligand-Based Low-Affinity Ca2+ Fluorescent Probes and Application to Intracellular Ca2+ Imaging
    Analytical Chemistry 2023 Nov.

2022年

  1. Atanas Kurutos, Yutaka Shindo, Yuki Hiruta, Kotaro Oka, Daniel Citterio
    Organelle-selective near-infrared fluorescent probes for intracellular microenvironment labeling
    Dyes and Pigments. 2022 Aug.
  2. Madoka K. Utsumi, Taichi Akahoshi, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    MiniSOG2-mediated Specific Photoablation of Motor Neurons in Ascidian Embryos.
    bioprotocol. 2022 Sep.
  3. Yuki S. Kogure, Hiromochi Muraoka, Wataru C. Koizumi, Raphaël Gelin-alessi, Benoit Godard, Kotaro Oka, C. P. Heisenberg, Kohji Hotta.
    Admp regulates tail bending by controlling ventral epidermal cell polarity via phosphorylated myosin localization
    Development. 2022 Oct.
  4. Miho Suzuki, Yutaka Shindo, Ryu Yamanaka, Kotaro Oka
    Live imaging of apoptotic signaling flow using tunable combinatorial FRET-based bioprobes for cell population analysis of caspase cascades
    Scientific Reports 2022 Dec.

2021年

  1. Kowarsky M, Anselmi C, Hotta K, Burighel P, Zaniolo G, Caicci F, Rosental B, Neff NF, Ishizuka KJ, Palmeri KJ, Okamoto J, Gordon T, Weissman IL, Quake SR, Manni L, Voskoboynik A.
    Sexual and asexual development: two distinct programs producing the same tunicate
    Cell Rep. 2021 Jan.
  2. Maiki K. Wakai, Mitsuru J. Nakamura, Satoshi Sawai, Kohji Hotta, and Kotaro Oka
    Two-Round Ca2+ Transient in Papillae by Mechanical Stimulation Induces Metamorphosis in the Ascidian Ciona intestinalis typeA.
    Proc Biol Sci. 2021 Jan.
  3. Yuki Hiruta, Yutaka Shindo, Kotaro Oka, and Daniel Citterio
    Small Molecule-based Alkaline-earth Metal Ion Fluorescent Probes for Imaging Intracellular and Intercellular Multiple Signals
    Chemistry Letters. 2021 Jan.
  4. Miyashiro S, Yamada Y, Muta T, Ishikawa H, Abe T, Hori M, Oka K, Koshikawa F, Ito E.
    Activation of the orbitofrontal cortex by both meditation and exercise: A near-infrared spectroscopy study
    PLoS One. 2021 Feb.
  5. Fujii Y, Koizumi WC, Imai T, Yokobori M, Matsuo T, Oka K, Hotta K, Okajima T.
    Spatiotemporal dynamics of single cell stiffness in the early developing ascidian chordate embryo
    Commun Biol. 2021 Mar.
  6. Arimura Y, Shindo Y, Yamanaka R, Mochizuki M, Hotta K, Nakahara T, Ito E, Yoshioka T, Oka K.
    Peripheral-neuron-like properties of differentiated human dental pulp stem cells (hDPSCs)
    PLoS One. 2021 May
  7. Shindo Y, Ikeda Y, Hiruta Y, Citterio D, Oka K.
    Development of Near-Infrared Fluorescent Mg 2+ Probe and Application to Multicolor Imaging of Intracellular Signals
    Methods Mol Biol. 2021 May
  8. Shindo Y, Fujita K, Tanaka M, Fujio H, Hotta K, Oka K.
    Mechanical stimulus-evoked signal transduction between keratinocytes and sensory neurons via extracellular ATP
    Biochem. Biophys. Res. Commun. 2021 Oct
  9. Taichi Akahoshi, Kouhei Oonuma, Makoto Murakami, Takeo Horie, Takehiro G. Kusakabe, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    A single motor neuron determines the rhythm of early motor behavior in Ciona
    Science Advances. 2021 In Press
  10. Koichi Matsuo, Ryota Tamura, Kohji Hotta, Mayu Okada, Akihisa Takeuchi, Yanlin Wu, Koh Hashimoto, Hidekazu Takano, Atsushi Momose, Atsuo Nishino
    Bilaterally asymmetric helical myofibrils in ascidian tadpole larvae
    Frontiers in Cell and Developmental Biology, section Morphogenesis and Patterning 2021 Nov
  11. Haruka M Funakoshi, Takumi T. Shito, Kotaro Oka, Kohji HOTTA
    Developmental Table and Three-dimensional Embryological Image Resource of the Ascidian Ascidiella aspersa
    Frontiers in Cell and Developmental Biology, section Morphogenesis and Patterning 2021 Dec

2020年

  1. Kaoru D Matsumura, Mitsuru J. Nakamura, Wataru C. Koizumi, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Different strategies for tissue scaling in dwarf tailbud embryos revealed by single-cell analysis
    Dev Biol. 2020 Jan.
  2. Yamanaka R, Shindo Y, Hotta K, Hiroi N, Oka K.
    Cellular thermogenesis compensates environmental temperature fluctuations for maintaining intracellular temperature
    Biochem Biophys Res Commun. 2020 Sep.
  3. Shindo Y, Yamanaka R, Hotta K, Oka K.
    Inhibition of Mg 2+ Extrusion Attenuates Glutamate Excitotoxicity in Cultured Rat Hippocampal Neurons
    Nutrients. 2020 Sep.
  4. Yuki Kogo, Chiaki Seto, Yuki Totani, Mai Mochizuki, Taka Nakahara, Kotaro Oka, Tohru Yoshioka, Etsuro Ito
    Rapid differentiation of human dental pulp stem cells to neuron-like cells by high K+ stimulation
    Biophysics and Physicobiology 2020 Sep.
  5. Atanas Kurutos,Yutaka Shindo, Yuki Hiruta, Kotaro Oka, Daniel Citterio
    Near-infrared pH responsive heptamethine cyanine platforms: Modulating the proton acceptor
    Dye and Pigments 2020 Oct.
  6. Kohji Hotta, Delphine Dauga and Lucia Manni
    The ontology of the anatomy and development of the solitary ascidian Ciona: the swimming larva and its metamorphosis.
    Sci Rep. 2020 Sep.
  7. Masahiro Inda, Kohji Hotta and Kotaro Oka
    High responsiveness of auditory neurons to a specific combination of acoustic features in female songbirds.
    European Journal of Neuroscience. 2020 Nov.
  8. Takumi T. Shito, Naohiro Hasegawa, Kotaro Oka, and Kohji Hotta
    Phylogenetic comparison of egg transparency in ascidians by hyperspectral imaging
    Sci Rep. 2020 Nov.

2019年

  1. Keita Ashdia, Kotaro Oka
    Stochastic thermodynamic limit on E. coli adaptation by information geometric approach
    Biochem. Biophys. Res. Commun. 2019 Jan.
  2. Keita Ashida, Taiki Kato, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Multiple tracking and machine learning reveal dopamine modulation for area-restricted foraging behaviors via velocity change in Caenorhabditis elegans
    Neurosci Lett. 2019 May.
  3. Keita Ashida, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    The Input-Output Relationship of AIY Interneurons in Caenorhabditis elegans in Noisy Environment
    iScience. 2019 Jul.
  4. Masahiro Inda, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Neural properties of fundamental function encoding of sound selectivity in the female avian auditory cortex.
    European Journal of Neuroscience. 2019 Nov.
  5. Murata O, Shindo Y, Ikeda Y, Iwasawa N, Citterio D, Oka K, Hiruta Y.
    Near-Infrared Fluorescent Probes for Imaging of Intracellular Mg2+ and Application to Multi-Color Imaging of Mg2+, ATP and Mitochondrial Membrane Potential.
    Anal Chem. 2019 Nov.
  6. Yamanaka R, Shindo Y, Oka K.
    Magnesium Is a Key Player in Neuronal Maturation and Neuropathology.
    Int J Mol Sci. 2019 Jul.
  7. Kei Shimizu, Keita Ashida, Kohji Hotta, Kotaro Oka.
    Food deprivation changes chemotaxis behavior in Caenorhabditis elegans.
    Biophysics and Physicobiology 2019 Volume 16 Pages 167-172.
  8. Haruka Mori, Keita Ashida, Hisashi Shidara, Tatsuya Nikai, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Serotonin modulates behavior-related neural activity of RID interneuron in Caenorhabditis elegans
    PLOS ONE. 2019 Dec.
  9. Keita Ashida, Hisashi Shidara, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Optical dissection of synaptic plasticity for early adaptation in Caenorhabditis elegans
    Neuroscience in press. 2019 .

2018年

  1. Kazuhiro Maeshima,Tomoki Matsuda,Yutaka Shindo,Hiromi Imamura,Sachiko Tamura,Ryosuke Imai,Syoji Kawakami,Ryosuke Nagashima,Tomoyoshi Soga,Hiroyuki Noji,Kotaro Oka,and Takeharu Nagai
    A Transient Rise in Free Mg2+ Ions Released from ATP-Mg Hydrolysis Contributes to Mitotic Chromosome Condensation
    Curr Biol., 2018 Jan.
  2. Mayu Hemmi,Yuma Ikeda,Yutaka Shindo,Takahiro Nakajima,Shigeru Nishiyama,Kotaro Oka,Moritoshi Sato,Yuki Hiruta,Daniel Citterio,Koji Suzuki
    Highly sensitive bioluminescent probe for thiol detection in living cells
    Chem Asian J., 2018 Jan.
  3. Rika Suzuki, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Transitional correlation between inner-membrane potential and ATP levels of neuronal mitochondria
    Sci Rep. 2018 Feb.
  4. Toshiki Yoshimizu, Hisashi Shidara, Keita Ashida, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Effect of interactions among individuals on the chemotaxis behaviours of Caenorhabditis elegans.
    J. Exp. Biol. 2018 Apr.
  5. Shinobu Hirai, Kohji Hotta, Haruo Okado
    Developmental Roles and Evolutionary Significance of AMPA‐Type Glutamate Receptors
    BioEssays. 2018 Aug.
  6. Yuji Mizotani, Mayu Suzuki, Kohji Hotta, Hidenori Watanabe, Kogiku Shiba, Kazuo Inaba, Etsu Tashiro, Kotaro Oka, Masaya Imoto
    14-3-3εa directs the pulsatile transport of basal factors toward the apical domain for lumen growth in tubulogenesis.
    Proc Natl Acad Sci U S A., 2018 Aug.
  7. Ryu Yamanaka, Yutaka Shindo, Kohji Hotta, Koji Suzuki, Kotaro Oka
    GABA-Induced Intracellular Mg2+ Mobilization Integrates and Coordinates Cellular Information Processing for the Maturation of Neural Networks
    Curr. Biol. 2018 Dec.

2017年

  1. Taichi Akahoshi, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Characterization of calcium transients during early embryogenesis in ascidians Ciona robusta (Ciona intestinalis type A) and Ciona savignyi
    Dev Biol., 2017 Sep.
  2. Shinobu Hirai, Kohji Hotta, Yoshihiro Kubo, Atsuo Nishino, Shigeo Okabe, Yasushi Okamura, Haruo Okado
    AMPA glutamate receptors are required for sensory-organ formation and morphogenesis in the basal chordate
    Proc Natl Acad Sci U S A., 2017 Mar.
  3. Hisashi Shidara, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Compartmentalized cGMP responses of olfactory sensory neurons in Caenorhabditis elegans.
    J Nuerosci., 2017 May.

2016年

  1. Ryo Tanamotoa, Yutaka Shindoa, Mariko Niwanoa, Yoshinori Matsumotob, Norihisa Mikic, Kohji Hottaa, Kotaro Oka
    Qualitative and quantitative estimation of comprehensive synaptic connectivity in short- and long-term cultured rat hippocampal neurons with new analytical methods inspired by Scatchard and Hill plots
    Biochem Biophys Res Commun., 2016 Feb.
  2. Yuichi Tanimoto, Takumi Hiraiwa, Yuichiro Nakai, Yutaka Shindo, Kotaro Oka, Noriko Hiroi, Akira Funahashi
    Detection of Temperature Difference in Neuronal Cells
    Sci Rep., 2016 Mar.
  3. Yutaka Shindo, Ryu Yamanaka, Koji Suzuki, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Altered expression of Mg2+ transport proteins during Parkinson's disease-like dopaminergic cell degeneration in PC12 cells.
    Biochim Biophys Acta., 2016 May.
  4. Yutaka Shindo, Hirokazu Komatsu, Kohji Hotta, Katsuhiko Ariga, Kotaro Oka
    An Artificial Reaction Promoter Modulates Mitochondrial Functions via Chemically Promoting Protein Acetylation
    Sci Rep., 2016 Jul.
  5. Ryu Yamanaka, Sho Tabata, Yutaka Shindo, Kohji Hotta, Koji Suzuki, Tomoyoshi Soga, Kotaro Oka
    Mitochondrial Mg(2+) homeostasis decides cellular energy metabolism and vulnerability to stress.
    Sci Rep., 2016 Jul.

2015年

  1. Yuji Mizotani, Shun Itoh, Kohji Hotta, Etsu Tashiro, Kotaro Oka, Masaya Imoto
    Evaluation of drug toxicity profiles based on the phenotypes of ascidian Ciona intestinalis
    Biochem Biophys Res Commun., 2015 Aug.
  2. Mariko Ogawa, Hisashi Shidara, Kotaro Oka, Masaru Kurosawa, Nobuyuki Nukina, Yoshiaki Furukawa
    Cysteine residues in Cu,Zn-superoxide dismutase are essential to toxicity in Caenorhabditis elegans model of amyotrophic lateral sclerosis
    Biochem Biophys Res Commun. 2015 Aug.
  3. Ryo Tanamoto, Yutaka Shindo, Norihisa Miki, Yoshinori Matsumoto, Kohji Hotta, Kotaro Oka Electrical stimulation of cultured neurons using a simply patterned indium-tin-oxide (ITO) glass electrode
    J Neurosci Methods., 2015 Sep.
  4. Hiroto Ogawa and Kotaro Oka Direction-Specific Adaptation in Neuronal and Behavioral Responses of an Insect Mechanosensory System
    J Neurosci. 2015 Aug.
  5. Yutaka Shindo, Ryu Yamanaka, Koji Suzuki, Kohji Hotta, Kotaro Oka, Intracellular magnesium level determines cell viability in the MPP+ model of Parkinson's disease
    Biochim Biophys Acta. 2015 Aug.
  6. Rika Suzuki, Kohji Hotta, Kotaro Oka Spatiotemporal quantification of subcellular ATP levels in a single HeLa cell during changes in morphology
    Sci Rep. 2015 Nov.
  7. Ryu Yamanaka, Yutaka Shindo, Takamasa Karube, Kohji Hotta, Koji Suzuki, Kotaro Oka Neural depolarization triggers Mg(2+) influx in rat hippocampal neurons
    Neuroscience. 2015 Dec.

2014年

  1. Takatoshi D Yokoyama, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Comprehensive Morphological Analysis of Individual Peripheral Neuron Dendritic Arbors in Ascidian Larvae using the Photoconvertible Protein Kaede
    Dev Dyn., 2014 Oct.
  2. Hirabayashi A, Shindo Y, Oka K, Takahashi D, Toshima K.
    Photodegradation of amyloid β and reduction of its cytotoxicity to PC12 cells using porphyrin derivatives.
    Chem Commun (Camb). 2014 Jul 11. [Epub ahead of print]
  3. Iwasaki M, Poulsen TM, Oka K, Hessler NA.
    Sexually dimorphic activation of dopaminergic areas depends on affiliation during courtship and pair formation.
    Front Behav Neurosci. 2014 Jun 11;8:210. doi: 10.3389/fnbeh.2014.00210. eCollection 2014.
  4. Lucia Manni, Fabio Gasparini, Kohji Hotta, Katherine J. Ishizuka, Lorenzo Ricci, Stefano Tiozzo, Ayelet Voskoboynik, Delphine Dauga
    Ontology for the asexual development and anatomy of the colonial chordate Botryllus schlosseri.
    PLoS ONE, 2014 May 1;9(5):e96434.
  5. Komatus H, Shindo Y, Oka K, Hill JP, Ariga K.
    Ubiquinone-Rhodol (UQ-Rh) for Fluorescence Imaging of NAD(P)H through Intracellular Activation.
    Angew Chem Int Ed Engl. 2014 Apr 7;53(15):3993-5.
  6. Shimoi T, Mizutani K, Kojima D, Kitamura Y, Hotta K, Ogawa H, Oka K.
    Identification of oscillatory firing neurons associated with locomotion in the earthworm through synapse imaging.
    Neuroscience. 2014 Mar 19;268C:149-158
  7. Fujii, Tomohiko; Shindo, Yutaka; Hotta, Kohji; Citterio, Daniel; Nishiyama, Shigeru; Suzuki, Koji; Oka, Kotaro
    Design and Synthesis of a FlAsH type Mg2+ Fluorescent Probe for Specific Protein Labeling
    Journal of the American Chemical Society, 2014, Feb 12;136(6):2374-81.
  8. Lucia Manni, Fabio Gasparini , Kohji Hotta, Katherine J. Ishizuka, Lorenzo Ricci, Stefano Tiozzo, Ayelet Voskoboynik, Delphine Dauga Ontology for the asexual development and anatomy of the colonial chordate Botryllus schlosseri
    PLoS One. 2014 May.

2013年

  1. Mai Iwasaki, Thomas M. Poulsen,Kotaro Oka, Neal A. Hessler
    Singing-Related Activity in Anterior Forebrain of Male Zebra Finches Reflects Courtship Motivation for Target Females
    PLOS ONE, 2013, Nov 29;8(11):e81725.
  2. Takahiko Kobayashi, Fumiaki Nagase, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Crosstalk between Second Messengers Predicts the Motility of the Growth Cone
    Sci Rep., 2013, Nov 1;3:3118.
  3. Mitsuru J Nakamura, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Raman spectroscopic imaging of the whole Ciona intestinalis embryo during development
    PLOS ONE, 2013 Aug 20;8(8):e71739. 
  4. Ryu Yamanaka, Yutaka Shindo, Kohji Hotta, Koji Suzuki, Kotaro Oka
    NO/cGMP/PKG Signaling Pathway Induces Magnesium Release Mediated by mitoKATP Channel Opening in Rat Hippocampal Neurons
    FEBS Lett. 2013 Jul 4. pii: S0014-5793(13)00507-3.
  5. Kobayashi J, Shidara H, Morisawa Y, Kawakami M, Tanahashi Y, Hotta K, Oka K.
    A method for selective ablation of neurons in C. elegans using the phototoxic fluorescent protein, KillerRed.
    Neurosci Lett. 2013 Jun 4. pii: S0304-3940(13)00500-4.
  6. Komatsu H, Shindo Y, Kawashima SA, Yamatsugu K, Oka K, Kanai M.
    Intracellular Activation of Acetyl-CoA by Artificial Reaction Promoter and Its Fluorescent Detection
    Chem. Commun., 2013, 49 (28), 2876 - 2878
  7. Hisashi Shidara, Junya Kobayashi, Ryo Tanamoto, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Odorant-induced membrane potential depolarization of AIY interneuron in Caenorhabditis elegans
    Neuroscience letters, 2013 Apr 29;541:199-203.

2012年

  1. Mitsuru J Nakamura, Jun Terai, Reiko Okubo, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    Three-Dimensional Anatomy of the Ciona intestinalis Tailbud Embryo at Single-cell Resolution
    Developmental Biology, 372(2):274-84, 2012 Supporting Page

     

    		 coverpicture
  2. Horita H, Kobayashi M, Liu WC, Oka K, Jarvis ED, Wada K.
    Specialized Motor-Driven dusp1 Expression in the Song Systems of Multiple Lineages of Vocal Learning Birds
    PLoS One,7(8):e42173, Online Journal, 2012
  3. Hiroi N, Klann M, Iba K, Heras Ciechomski PD, Yamashita S, Tabira A, Okuhara T, Kubojima T, Okada Y, Oka K, Mange R, Unger M, Funahashi A, Koeppl H
    From microscopy data to in silico environments for in vivo-oriented simulations
    EURASIP J Bioinform Syst Biol., 2012(1):7, Online Journal, 2012

2011年

  1. Matsui A., Umezawa K, Shindo Y., Fujii T., Citterio D., Oka K., Suzuki K.
    A Near-Infrared Fluorescent Calcium Probe: a New Tool for Intracellular Multicolor Ca2+ Imaging
    Chem. Commun. (Camb), 2011, Oct 7;47(37):10407-9.
  2. Yutaka Shindo, Tomohiko Fujii, Hirokazu Komatsu, Daniel Citterio, Kohji Hotta, Koji Suzuki, Kotaro Oka: Newly Developed Mg2+?Selective Fluorescent Probe Enables Visualization of Mg2+ Dynamics in Mitochondria
    PLoS One. 2011; Accepted
  3. Kawada T, Ogasawara M, Sekiguchi T, Aoyama M, Hotta K, Oka K, Satake H. : Peptidomic Analysis of the Central Nervous System of the Protochordate, Ciona intestinalis: Homologs and Prototypes of Vertebrate Peptides and Novel Peptides. Endocrinology. 2011 Apr 5. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21467196.
  4. Mamiko Suzuki, Tetsuya Kimura, Hiroto Ogawa, Kohji Hotta, Kotaro Oka: Chromatophore Activity during Natural Pattern Expression by the Squid Sepioteuthis lessoniana: Contributions of Miniature Oscillation
    PLoS One. 2011; Published online 2011 April 1.

2010年

  1. Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, et al.: CIPRO 2.5: Ciona intestinalis protein database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with user rating and reviewing functionality. Nucleic Acids Res 2010.
  2. Shindo Y, Fujimoto A, Hotta K, Suzuki K, Oka K: Glutamate-induced calcium increase mediates magnesium release from mitochondria in rat hippocampal neurons.J Neurosci Res 2010, 88:3125-3132.
  3. Terakubo HQ, Nakajima Y, Sasakura Y, Horie T, Konno A, Takahashi H, Inaba K, Hotta K, Oka K: Network structure of projections extending from peripheral neurons in the tunic of ascidian larva. Dev Dyn 2010, 239:2278-2287.
  4. Tassy O, Dauga D, Daian F, Sobral D, Robin F, Khoueiry P, Salgado D, Fox V, Caillol D, Schiappa R, Laporte B, Rios A, Luxardi G, Kusakabe T, Joly JS, Darras S, Christiaen L, Contensin M, Auger H, Lamy C, Hudson C, Rothbächer U, Gilchrist MJ, Makabe KW, Hotta K, Fujiwara S, Satoh N, Satou Y, Lemaire P : The ANISEED database: digital representation, formalization, and elucidation of a chordate developmental program. Genome Res 2010, 20:1459-1468.
  5. Takahashi H, Hotta K, Takagi C, Ueno N, Satoh N, Shoguchi E: Regulation of notochord-specific expression of Ci-Bra downstream genes in Ciona intestinalis embryos.Zoolog Sci 2010, 27:110-118.
  6. Niino Y, Hotta K, Oka K: Blue fluorescent cGMP sensor for multiparameter fluorescence imaging.PLoS One 2010, 5:e9164.
  7. Okazaki S, Kanoh S, Tsukada M, Oka K: Neural substrate of sound duration discrimination during an auditory sequence in the guinea pig primary auditory cortex. Hear Res 2010, 259:107-116.
  8. Konno A, Kaizu M, Hotta K, Horie T, Sasakura Y, Ikeo K, Inaba K: Distribution and structural diversity of cilia in tadpole larvae of the ascidian Ciona intestinalis. Dev Biol 2010, 337:42-62.
 

2009年

  1. Yamada S, Hotta K, Yamamoto TS, Ueno N, Satoh N, Takahashi H: Interaction of notochord-derived fibrinogen-like protein with Notch regulates the patterning of the central nervous system of Ciona intestinalis embryos.Dev Biol 2009, 328:1-12.
  2. Suzuki M, Kimura T, Ogawa H, Hotta K, Oka K: FMRFamide elicits chromatophore expansion and retraction depending on its type and development in the squid, Sepioteuthis lessoniana. Invert Neurosci 2009, 9:185-193.
  3. Yanashima R, Kitagawa N, Matsubara Y, Weatheritt R, Oka K, Kikuchi S, Tomita M, Ishizaki S: Network Features and Pathway Analyses of a Signal Transduction Cascade. Front Neuroinformatics 2009, 3:13.
  4. Niino Y, Hotta K, Oka K: Simultaneous live cell imaging using dual FRET sensors with a single excitation light.PLoS One 2009, 4:e6036.
  5. Morita K, Saito Y, Sato K, Oka K, Hotta K, Sakakibara Y: Genome-wide searching with base-pairing kernel functions for noncoding RNAs: computational and expression analysis of snoRNA families in Caenorhabditis elegans. Nucleic Acids Res 2009, 37:999-1009.
  6. Hasegawa Y, Honda A, Umezawa K, Niino Y, Oka K, Chiba T, Aiso S, Tanimoto A, Citterio D, Suzuki K:Cell-based in vivo dual imaging probes using genetically expressed tags and chemical contrast agents. Chem Commun (Camb) 2009:4040-4042.

2008年

  1. Ogawa H, Cummins GI, Jacobs GA, Oka K: Dendritic design implements algorithm for synaptic extraction of sensory information. J Neurosci 2008, 28:4592-4603.
  2. Matsubara Y, Kikuchi S, Sugimoto M, Oka K, Tomita M: Algebraic method for the analysis of signaling crosstalk. Artif Life 2008, 14:81-94.
  3. Aonuma H, Kitamura Y, Niwa K, Ogawa H, Oka K: Nitric oxide-cyclic guanosine monophosphate signaling in the local circuit of the cricket abdominal nervous system. Neuroscience 2008, 157:749-761. 
  4. Satou Y, Mineta K, Ogasawara M, Sasakura Y, Shoguchi E, Ueno K, Yamada L, Matsumoto J, Wasserscheid J, Dewar K, et al.: Improved genome assembly and evidence-based global gene model set for the chordate Ciona intestinalis: new insight into intron and operon populations.Genome Biol 2008, 9:R152.
  5. Hotta K, Takahashi H, Satoh N, Gojobori T: Brachyury-downstream gene sets in a chordate, Ciona intestinalis: integrating notochord specification, morphogenesis and chordate evolution.Evol Dev 2008, 10:37-51.
  6. Homma K, Niino Y, Hotta K, Oka K: Ca(2+) influx through P2X receptors induces actin cytoskeleton reorganization by the formation of cofilin rods in neurites. Mol Cell Neurosci 2008, 37:261-270.
  7. Aoyama M, Kawada T, Fujie M, Hotta K, Sakai T, Sekiguchi T, Oka K, Satoh N, Satake H: A novel biological role of tachykinins as an up-regulator of oocyte growth: identification of an evolutionary origin of tachykininergic functions in the ovary of the ascidian, Ciona intestinalis.Endocrinology 2008, 149:4346-4356.

 

IntnlMeeting

2012年

  1. T.KOBAYASHI, F.NAGASE, K.HOTTA, K.OKA
    Simultaneous Measurement of cAMP and cGMP in Growth Cone and Glia Cells with Dual FRET Microscopy. Society for Neuroscience 42th annual meeting ポスター発表
    New Orleans(Oct 14, 2012)
  2. Hisashi Shidara, Junya Kobayashi, Ryo Tanamoto, Kohji Hotta, and Kotaro Oka
    Neural activity visualization of AIY interneuron in Caenorhabditis elegans with voltage-sensitive fluorescent protein
    Neuroscience 2012, SfN's 42nd annual meeting ポスター発表
    Ernest N. Morial Convention Center., Orieans, America　（2012年10月14日）
  3. Kohji Hotta
    Three-Dimensional Anatomy of the Ciona intestinalis Tailbud Embryo at Single-cell Resolution
    2012 Asia-Pacific Developmental Biology Conference (APDBC)
    Taipei Innovation City Convention Center 台北矽谷國際會議中心2012年10月5日
    ポスター&口頭発表
  4. 堀田耕司
    Construction of 3D Virtual Tailbud Embryo For Quantitative Approach
    CDB Symposium 2012 "Quantitative Developmental Biology "
    2012年3月26日～28日
    理化学研究所　発生・再生科学総合研究センター（神戸）ポスター発表
    www.cdb.riken.jp/sympo2012/

2011年

  1. T.KOBAYASHI, K.HOTTA, K.OKA
    Kinetic Analysis of Cofilin Rods Formation in Differentiated PC12 Cells
    Society for Neuroscience 41th annual meeting ポスター発表
    Washington DC (Nov 16, 2011)
  2. Shindo Y., Hotta K., Suzuki K., Oka K.
    1-methyl-4-phenyl-pyridinium ion (MPP+) altered expression levels of Mg2+ transport proteins in PC12 cells
    Society for Neuroscience, 2011. 11. 12-16, Washington DC, USA, (ポスター）
  3. Ryu, Yamanaka; Yutaka, Shindo; Kohji, Hotta; Koji, Suzuki; Kotaro Oka.
    Mg2+ influx and release from intracellular store induced by GABA stimuli in rat hippocampal Neurons  41st Society for Neuroscience, 2011. 11. 12-16, Washington DC, USA, (ポスター）
  4. Jun Terai, Mayu Suzuki, Masaya Imoto, Etsu Tashiro, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    Analysis of phenotype caused by temporal treatment of SU4984 in Ciona intestinalis embryo
    The 6th International Tunicate Meeting, ポスター発表
    McGill Univ., Montreal, Canada
    (2011年７月３〜７日)
  5. Mitsuru J. Nakamura, Jun Terai, Reiko Okubo, Kohji Hotta and Kotaro Oka
    Three-dimensional cellular-level anatomy and comprehensive annotation of tailbud embryo in Ciona intestinalis
    The 6th International Tunicate Meeting, ポスター&口頭発表
    McGill Univ., Montreal, Canada
    (2011年７月３〜７日)

2010年

  1. *F. TAKAYAMA1, H. HARUHITO2, K. HOTTA1, K. OKA1 
    170.3/FF7 - In vivo pH imaging of auditory stimulation-induced neural activity in female zebra finch ,Society for Neuroscience 40th annual meeting, San Diego, Nov 13-17, 2010
  2. *H. OGAWA1,2, K. OKA3, 286.17/AAA18 - Relationships between spatio-temporal pattern of the dendritic Ca2+ accumulation and alternation of the directional selectivity in the identified projection interneurons  Society for Neuroscience 40th annual meeting, San Diego, Nov 13-17
  3. *H. HORITA1,2, M. KOBAYASHI3, K. OKA2, E. D. JARVIS1, K. WADA4, 411.11/OOO26 - Repeated evolution of activity-dependent motor-driven dusp1 expression in song nuclei of vocal learning birds  ,Society for Neuroscience 40th annual meeting, San Diego, Nov 13-17, 2010
  4.  *R. YAMAZAKI1, Y. NIINO2, K. HOTTA1, K. OKA1, 515.8/OOO47 - Subcellular analysis of paxillin contribution to bradykinin-induced neurite retraction with a photoinactivatable paxillinSociety for Neuroscience 40th annual meeting, San Diego, Nov 13-17, 2010
  5. *M. YAMAMOTO, F. TAKAYAMA, K. HOTTA, K. OKA , 774.12/HH6 - Neuronal cytoarchitecture of hippocampal formation in female zebra finch Society for Neuroscience 40th annual meeting, San Diego, Nov 13-17, 2010
  6.  *J. KOBAYASHI1, K. OKUDA2, K. HOTTA1, K. OKA1 , 811.19/MMM12 - In vivo calcium imaging of AIY interneuron related to early adaptation in C. elegansSociety for Neuroscience 40th annual meeting, San Diego, Nov 13-17, 2010
  7. Hira, Yuichiro, Terai, Jun, Imoto, Masaya, Tashiro, Etsu, and Hotta, Kohji. ACBD: Database for Ascidian Chemical Genomics. Available from Nature Precedings <http://dx.doi.org/10.1038/npre.2010.5087.1> (2010)
  8. Kohji Hotta Current status of tunicate databases, FABA
    1st Tunicate Information System Meeting、口頭発表
    Nice, France (2010年11月11-13日)
  9. Yuichiro Hira, Jun Terai, Mitsuru Nakamura, Etsu Tashiro, Masaya Imoto, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    ACBD: Database for Ascidian Chemical Genomics 
    BioCurationMeeting、ポスター発表
    東京国際交流館(2010年10月11-14日)
  10. Kohji HOTTA, Hiroshi Q TERAKUBO, Mitsuru Nakamura, Yoko NAKAJIMA, Yasunori SASAKURA, Takeo HORIE, Alu KONNO, Hiroki TAKAHASHI, Kazuo INABA, Kotaro OKA
    ASNET: Actin-based network structure in the tunic of ascidian larva
    Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists、ポスター発表, Albuquerque, New Mexico, USA(2010年8月5-9日)
  11. Mitsuru Nakamura, Jun Terai, Kohji Hotta and Kotaro Oka
    Quantitative analysis of ascidian tailbud stage embryo at single cell level by constructing 3D Virtual Embryo
    Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists、ポスター発表, Albuquerque, New Mexico, USA(2010年8月5-9日)
  12. Jun Terai, Mayu Suzuki, Masaya Imoto, Etsu Tashiro, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    FGFR inhibitor affect proliferation of tail epidermal cells and cause neural tube closure defect in ascidian Ciona intestinalis
    Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists、ポスター発表, Albuquerque, New Mexico, USA(2010年8月5-9日)
  13. Yuichiro Hira, Kohji Hotta, Etsu Tashiro, Masaya Imoto, Kotaro Oka
    ACDB: Database for Ascidian Chemical Genomics
    Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists、ポスター発表, Albuquerque, New Mexico, USA(2010年8月5-9日)
  14. KOHJI HOTTA, Hiroshi Terakubo, Yoko Nakajima, Yasunori Sasakura, Takeo Horie, Alu Konno, Hiroki
    Takahashi, Kazuo Inaba, Kotaro Oka
    Actin-based network structure in the tunic of ascidian larva revealed by confocal laser scanning and
    transmission electron microscopes (共焦点顕微鏡および透過型電子顕微鏡により明らかにされたホヤ幼生被嚢内新規ネットワーク構造) 
    43rd Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists Jointly Sponsored by the Asia-Pacific Developmental Biology Network, 口頭発表, Kyoto, International Conference Center (2010年6月21-23日)
  15. Kohji HOTTA, Hiroshi Q TERAKUBO, Yoko NAKAJIMA, Alu KONNO, Takeo HORIE, Hiroki TAKAHASHI, Yasunori SASAKURA, Kazuo INABA, Kotaro OKA
    Ascidian dendritic network in tunic
    2ND JOINT MEETING OF THE SFBD AND JSDB 2010 - From Cells to Organs, Institut Pasteur, Paris, France (2010年5月26- 28）

domesticmeeting

2012年

  2. 中村允・堀田耕司・岡浩太郎
    Label-free observation of bio-molecular localization corresponding to the cell fate during Ciona intestinalis embryogenesis by Raman spectroscopic imaging
    カタユウレイボヤ発生過程における細胞分化に対応した局在シグナルのラマン顕微鏡を用いた探索
    分子生物学会内ワークショップ・生体分子イメージングへの新たな挑戦～ラマン分光、プローブレスイメージングによる分子機能解析とがん診断への応用～、(2012年12月11-14日)、口頭発表
  3. 横山貴星・堀田耕司・岡浩太郎
    Direction of peripheral neurons projection in Ciona intestinalis larval tunic revealed by imaging analysis.
    イメージング解析により明らかになったカタユウレイボヤ幼生被嚢内における末梢神経の投射方向
    分子生物学会(2012年12月11-14日)、ポスター発表
  4. 設樂久志・小林純也・棚元亮・堀田耕司・岡浩太郎
    線虫AIY介在神経細胞での局在した神経活動：蛍光イメージングによる研究
    Localized neural activities in AIY interneuron of Caenorhabditis elegans : fluorescent imaging study
    日本生物物理学会　第50回大会
    名古屋大学　東山キャンパス（2012年9月24日）、ポスター発表
  5. 中村允・堀田耕司・岡浩太郎
    ラマン顕微鏡を用いたホヤ発生過程のラベルフリーイメージング
    最先端光計測とライフサイエンスの近未来－バイオ・ラマン２０１７－［２］
    （独）理化学研究所（和光市）(１０月２５日~１０月２７日),口頭発表
  6. 中村允・堀田耕司・岡浩太郎
    カタユウレイボヤ初期胚におけるラマン顕微鏡による細胞内分子の検出
    第５０回日本生物物理学会、名古屋大学東山キャンパス(９月２２日から９月２４日)、ポスター発表
  7. 小林孝彦、永瀬史章、堀田耕司、岡浩太郎
    dual FRETイメージング法を用いた成長円錐およびグリア細胞におけるセカンドメッ
    センジャークロストークのメカニズム
    Mechanism of Second Messenger’s Crosstalk in Growth Cone and Glia Cells
    Revealed by Dual FRET Microscopy
    第35回日本神経科学大会
    名古屋国際会議場 (2012年9月21日)     、ポスター発表
  8. 小林孝彦、永瀬史章、堀田耕司、岡浩太郎
    dual FRETイメージング法を用いた成長円錐およびグリア細胞におけるセカンドメッセンジャークロストークのメカニズム
    Mechanism of Second Messenger’s Crosstalk in Growth Cone and Glia Cells Revealed by Dual FRET Microscopy
    第35回日本神経科学大会
    名古屋国際会議場 (2012年9月21日)、ポスター発表
  9. 宮澤孝彰、大川皓司、岡浩太郎、堀澤健一、土居信英
    神経軸索先端における局所翻訳制御機構の解析に向けた新生タンパク質標識技術の開発
    Labeling of nascent proteins for analysis of local translation regulatory mechanism at axons
    第35回日本神経科学大会
    名古屋国際会議場 (2012年9月19日)、ポスター発表
  10. 山中龍、新藤豊、堀田耕司、鈴木孝治、岡浩太郎
    ラット海馬神経細胞における一酸化窒素がもたらす細胞内マグネシウム動員
    第35回日本神経科学大会 （2012年9月18日- 21日）
  11. 設樂久志・小林純也・棚元亮・堀田耕司・岡浩太郎
    線虫介在神経細胞AIYの膜電位イメージング
    Membrane Potential Imaging of interneuron AIY in Caenorhabditis elegans
    日本神経科学学会　第35回大会
    名古屋国際会議場（2012年9月20日）、ポスター発表
  12. 中村允・堀田耕司・岡浩太郎
    ラマン顕微鏡を用いたカタユウレイボヤ発生過程における分子局在の非標識観察
    日本動物学会第８３回大阪大会、大阪大学豊中キャンパス(９月１３日~９月１５日), 口頭発表
  13. 中村　允, 寺井 淳，大久保 怜子，堀田 耕司，岡 浩太郎
    バイオイメージングによる発生過程モデル化のための細胞情報取得の試み
    第２２回日本数理生物学会大会
    岡山大学自然科学研究科棟、2012 年9 月10 日(月)-12 日(水)
  14. 中村　允，寺井 淳，大久保 怜子，堀田 耕司，岡 浩太郎
    発生過程のモデル化に有用な細胞内物質局在および形態情報の取得
    広島大学大学院理学研究科数理分子生命理学専攻 第４回公開シンポジウム
    広島大学理学研究科E棟（2012年9月6～7日）、ポスター発表
  15. 中村允・寺井淳・大久保玲子・堀田耕司・岡浩太郎
    先端光計測とライフサイエンスの近未来－バイオ・ラマン２０１７－［１］
    ラマン分光顕微鏡を用いたホヤ胚における組織・生体物質の識別
    （独）理化学研究所（和光市）（５月１８日～５月１９日）, ポスター＆口頭発表

2011年

  1. 小林孝彦、堀田耕司、岡浩太郎
    細胞局所におけるコフィリンロッド形成の速度論的解析
    Kinetic Analysis of Cofilin Rods Formation in Local Cell Regions
    第34回日本神経科学大会、ポスター発表
    パシフィコ横浜 (2011年9月14日)
  2. 小林孝彦、堀田耕司、岡浩太郎
    コフィリンロッド形成および消失の速度論的解析
    Diffusion Control Causes Difference of Kinetics in the Same Cell
    第20回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    千歳科学技術大学 (2011年9月1日)
  3. Shindo Y., Fujii T., Yamanaka R., Hotta K., Suzuki K., Oka K
    Measurements of local magnesium concentration changes in neurons
    神経細胞内の局所的なマグネシウム濃度変化の計測
    日本神経科学学会、2011年9月14－17日、横浜、（ポスター）
  4. 寺井淳・中村允・鈴木麻友・井本正哉・岡浩太郎・田代悦・堀田耕司
    ホヤ胚形態形成におけるSU4984の効果について
    第82回日本動物学会旭川大会、ポスター発表
    旭川市大雪クリスタルホール（2011年9月21～23日）
  5. 中村允・寺井淳・大久保玲子・堀田耕司・岡浩太郎
    Three-dimensional cellular-level anatomy and comprehensive annotation of tailbud embryo in Ciona intestinalis
    第82回日本動物学会旭川大会、ポスター発表
    旭川市大雪クリスタルホール（2011年9月21～23日）
  6. 堀田耕司・日良祐一郎・寺井淳・大久保玲子・岡浩太郎
    A database for Ascidian Chemical Genomics
    第82回日本動物学会旭川大会、ポスター発表
    旭川市大雪クリスタルホール（2011年9月21～23日）
  7. 小林孝彦、堀田耕司、岡浩太郎
    細胞局所におけるコフィリンロッド形成の速度論的解析
    Kinetic Analysis of Cofilin Rods Formation in Local Cell Regions
    第34回日本神経科学大会、ポスター発表
    パシフィコ横浜 (2011年9月14日)
  8. Shindo Y., Fujii T., Yamanaka R., Hotta K., Suzuki K., Oka K
    Measurements of local magnesium concentration changes in neurons
    神経細胞内の局所的なマグネシウム濃度変化の計測
    日本神経科学学会、2011年9月14－17日、横浜、（ポスター）
  9. 山中龍、新藤豊、堀田耕司、鈴木孝治、岡浩太郎

    ラット海馬神経細胞におけるGABA刺激による細胞内マグネシウムの測定

    第34回日本神経科学大会 2011年9月14-17日  横浜　(ポスター)
  10. 小林孝彦、堀田耕司、岡浩太郎
    コフィリンロッド形成および消失の速度論的解析
    Diffusion Control Causes Difference of Kinetics in the Same Cell
    第20回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    千歳科学技術大学 (2011年9月1日)
  11. 山中龍、新藤豊、堀田耕司、鈴木孝治、岡浩太郎

GABA刺激による神経細胞マグネシウム動員 第20回日本バイオイメージング学会学術集会  千歳科学技術大学（2011年9月1日）   

 

2010年

  1. 寺井淳、鈴木麻友、日良裕一郎、井本正哉、岡浩太郎、田代悦、堀田耕司
    ケミカルゲノミクスによるホヤ胚形態形成に関わる分子の探索と機能解析
    Screening and Functional Analysis of Molecules Related to Morphogenesis of Ascidian by Chemical Genomics
    日本ケミカルバイオロジー学会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年5月18日）
  2. 新藤豊、藤井智彦、小松広和、堀田耕司、鈴木孝治、岡浩太郎
    新規蛍光プローブを用いたミトコンドリア内マグネシウムイメージング
    Mitochondrial Magnesium Imaging Using Newly Developed Fluorescent Probe
    日本ケミカルバイオロジー学会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年5月18日）
  3. 寺井淳、中村允、鈴木麻友、井本正哉、岡浩太郎, 田代悦、堀田耕司
    共焦点顕微鏡を用いた化合物添加による形態異常胚の高解像度スクリーニング
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  4. 中村允, 寺井淳, 大久保玲子, 堀田耕司, 岡浩太郎
    ホヤ尾芽胚の共焦点顕微鏡画像に基づく１細胞レベルでのCG（ｺﾝﾋﾟｭｰﾀ･ｸﾞﾗﾌｨｯｸ）化と幾何解析
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  5. 小林純也、森澤勇馬、川上真季、棚橋裕太、堀田耕司、岡浩太郎
    蛍光タンパク質KillerRedを用いた線虫神経細胞の新規選択的破壊法の確立
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  6. 鈴木真美子、木村哲也、小川宏人、堀田耕司、岡浩太郎
    Intact イカの色素胞活動解析によるパターン形成メカニズムの解明
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  7. 山崎亮輔、新野祐介、堀田耕司、岡浩太郎
    蛍光タンパク質KillerRedを用いた神経突起退縮における細胞内パキシリンの部位特異的機能の解析
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  8. 高山文博、堀田耕司、岡浩太郎
    pHイメージング法を用いた音刺激に伴うメスキンカチョウ海馬体神経活動のリアルタイム計測
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  9. 新藤豊、藤本愛、堀田耕司、鈴木孝治、岡浩太郎
    高濃度グルタミン酸刺激に対するラット海馬神経細胞内でのCa2+，Mg2+濃度変化の解析
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  10. 山本真千子、高山文博、堀田耕司、岡浩太郎
    メスキンカチョウ海馬体における神経細胞構築のマルチカラーイメージングによる解析
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  11. 棚元亮、堀田耕司、三木則尚、松本佳宣、岡浩太郎
    μデバイスを用いた神経細胞形態変化とカルシウムイオン動態に関する研究
    第19回日本バイオイメージング学会学術集会、ポスター発表
    慶應義塾大学（2010年9月9～11日）
  12. 堀田耕司，寺久保洋，中島陽子，紺野在, 堀江健夫, 高橋弘樹，笹倉靖徳，稲葉一男，岡浩太郎
    ホヤ幼生末梢神経から被嚢内へ伸びた突起が形成するネットワーク構造の解析
    Network structure of projections extending from peripheral neurons in tunic of ascidian larva
    日本動物学会第 81回大会、口頭発表
    東京大学教養学部（2010年9月23~25日）
  13. 日本動物学会第８３回大阪大会
    中村允・堀田耕司・岡浩太郎
    ラマン顕微鏡を用いたカタユウレイボヤ発生過程における分子局在の非標識
    大阪大学豊中キャンパス (９月１３日から９月１５日) 口頭発表
  14. 寺井淳・中村允・鈴木麻友・井本正哉・岡浩太郎・田代悦・堀田耕司
    FGFR阻害剤添加により引き起こされるホヤ胚形態変異の解析
    The Analysis of Morphological Defect Caused by Treatment of a FGFR Inhibitor in Ascidian, Ciona intestinalis
    日本動物学会第 81回大会、口頭発表
    東京大学教養学部（2010年9月23~25日）
  15. 中村允・寺井淳・大久保玲子・堀田耕司・岡浩太郎
    コンピュータ・モデリングによるホヤ尾芽胚の１細胞レベルでの形態解析
    日本動物学会第 81回大会、口頭発表
    東京大学教養学部（2010年9月23~25日）
  16. 中村允・寺井淳・大久保玲子・堀田耕司・岡浩太郎
    ホヤ初期尾芽胚における１細胞レベルでのコンピュータ・モデリングによる胚幾何情報の抽出
    Extracting Geometrical Information from normal ascidian tailbud-stage embryo at single cell level by constructing 3D Virtual Embryo
    第33回日本分子生物学会年会、ポスター発表
    神戸ポートアイランド（2010年12月7～10日）
  17. 寺井淳・中村允・鈴木麻友・井本正哉・岡浩太郎・田代悦・堀田耕司
    FGFR阻害剤添加によって引き起こされたホヤ胚の形態変異の定量的解析
    Analysis of Mutant Phenotype Caused by the FGFR Inhibitor in Ascidian, Ciona intestinalis
    第33回日本分子生物学会年会、ポスター発表
    神戸ポートアイランド（2010年12月7～10日）
  18. Shindo Y., Fujii T., Kubota T., Komatsu H., Hotta K., Suzuki K., Oka K.
    Imaging of Cellular Magnesium
    第16回武田科学振興財団生命科学シンポジウム，2010年12月1－2日，東京、（ポスター）

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